双子のDNAを検査したらおかしな結果が出た…DNA検査は眉に唾して受けよう

【抄訳】
あなたが自分の唾液を真面目に郵送したことのある方なら、今のDNA検査企業が送り返してくる予想外の結果にも興味津々だろう。あなたの祖先は、イベリア半島でうろうろしていたのか? あなたの家族の何代にもわたる言い伝えの中に、科学が認めるものがあるとすれば、それはなんだろう?

メールオーダーのDNA検査を利用する人たちの多くは、その結果の背後にある科学について無頓着だ。なにしろ、それは科学だから。でも、DNA検査企業は強力な監督機関を欠き、自分たちのアルゴリズムをオープンにしないから、ユーザーが得たいと思っている先祖に関する知見が、これらの企業がそうでないと言えば言うほど、主観的であることもありうるのだ。

その点に関して、CBCのMarketplaceのホストCharlsie Agroと彼女の双子の妹Carlyが、5社のDNA検査キットを郵送してみた: それらは、23andMe、 AncestryDNA、 MyHeritage、 FamilyTreeDNA、そしてLiving DNAだ。

CBCはこう報告した: “事実上同一のDNAでありながら、この双子たちはどの企業からも互いに合致する結果をもらえなかった”。

このことに、驚くべきではない。各社が、それぞれ独自の試薬を使ってDNAを分析するから、違いが生ずるのは当然だ。たとえばある一社、FamilyTreeDNAは、双子のDNAの14%が中東起源とした。それは他の4社にはない結果だった。

それ以外では、素人でも予想できるような当たり前の結果が多い。しかし、23andMeのデータだけはおかしい。

CBSはこう言ってる:

23andMeの所見では、先祖が“大まかにヨーロッパ人”(“Broadly European”)はCharlsieがCarlyより10%近く少ない。Charlsieにはフランス人とドイツ人が各2.6%あるが、Carlyにはない。〔下図〕

この互いに同一の双子は、東ヨーロッパ人の継承も異なり、Charlsieの28%に対しCarlyは24.7%だ。そしてCarlyの東ヨーロッパ人の祖先はポーランドに結びついているが、Charlsieの結果にはこの国がない。

この双子は彼女らのDNAをエール大学の計算生物学グループと共有し、二つのDNAが統計学的に同一、と判定された。疑問に対して23andMeは、同社の分析が“統計的推定”だ、と言った。あなたが顧客なら、この言葉を覚えておくべきだ。

覚えておいた方がよいのは、その検査が正しい科学ではないことだ。対照群はないし、標本サイズは双子のDNAワンセットだけだ。ここから決定的な結果は導けない。でも、興味深い疑問が生ずることは確かだ。

アップデート: 23andMeのスポークスパーソンが次のような声明で、問題の結果のコンテキストを明かそうとしている:

CharlsieとCarlyの23andMeの結果の変位は主に、“大まかにヨーロッパ人”の推定値にある。このカテゴリーはわれわれのアルゴリズムが確信を持ってヨーロッパ人と同定できる層を捉えているが、国などもっと精密な分類の確信はない。双子の一方がより多くの“おおまかにヨーロッパ人”を持っていても、それは矛盾していない。それが意味するのは、一つの個体に関してはアルゴリズムが、より細かい粒度の予測をできるほどの確信を持っていなかったことである。たとえば双子の片方に関しては2.6%のフランス人とドイツ人を同定できたが、他方関してはゲノムのその部分が大まかにヨーロッパ人に割り当てられたのである。

同社が強調するのは、23andMeの先祖検査と健康診断のそれとの違いだ。後者はFDAの規則があり、その基準と精度と臨床的有効性を満たさなければならない。

双子の調査は長年、科学研究において重要な役割を担ってきた。たとえば双子の調査により、中毒や精神病、心疾患などさまざまな特性への生物学的影響と環境的影響の違いを研究できる。23andMeのような企業の場合は、双子の調査が〔今回のように〕同社の秘密のアルゴリズムの特質を明らかにし、ユーザーに対する今後の知見や、企業としての売上のアップに貢献するだろう。

【中略】

民間のDNA検査サービスは、祖先の判定だけでなく、将来の遺伝子病発病の可能性や、健康的な生活のためのアドバイスなど、‘商品’のメニューが多様化している。しかも検査の方法は年々変化し進化している。それとともに検査の‘結果’も変わる。

そこでもう一度言えば、CBCの非公式な実験は決して本物の科学ではなく、またDNA検査サービスもそうだ。ご自分の検査結果をどきどきしながら待っている方に申し上げたいのは、これらの企業がどうやってその結論に到達したのか、その方法や過程や理論について、われわれは知らないことが多すぎる。そのような営利企業を介してあなたの遺伝学的データが大手製薬企業の手に渡るとしたら、そこにはプライバシーをめぐる大きなトレードオフがある。こいつは、よーく考えてみたい問題だよね。

関連記事: 23andMeの祖先判定ツールが黒人や黄色人種に対しても詳しくなった

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(翻訳:iwatani(a.k.a. hiwa

AncestryDNAとGoogleのCalicoが共同で遺伝子操作による長寿の可能性を研究

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シリコンバレーには、不死に関するサイトで当てようとする人びとが少なくない。死を少しでも遅くするための取り組みなら、Googleの中にもある。今回は、最大の家系調査サイトAncestry.comの一部門であるAncestryDNAが、Googleの中の修道院のような企業Calicoとパートナーして、人間の遺伝子と長寿との関係を研究することになった。

AncestryDNAは100万人以上の人びとの遺伝子データと家系図をホストし、それらは数百年の過去にさかのぼることができる。

計画ではその、Ancestryのデータベースにある100万の公開家系データを匿名化したうえで調べて、長寿が遺伝形質か否かを判定する。Calicoはその結果に基づいて、商用の長寿療法を開発する。

CalicoのCSO(Chief Scientific Officer) David Botsteinは声明文の中で次のように述べている: “昔から誰もが、長寿には遺伝的な要因もあるのではないか、と思わせる現象に遭遇している。しかし遺伝子工学の標準的な手法では、長寿を司る遺伝子を見つけることは難しい。今回われわれは特異な機会に恵まれ、人間の高品質な家系図を用いる研究により、長寿に関するまだ答えられていない基本的な疑問を解明したいと願っている”。

科学者たちはすでに、人間を長寿にする遺伝子を同定している。またマウスを使った遺伝子治療では、DNA操作により不死の生命、もしくは地上における長寿の、実現の可能性が示された。

でも、Googleの“未来学者”Ray Kurzweilも以前言っていたけど、“寿命は統計的な現象であり、誰にでも、明日バスにはねられる確率はあるのである”。

 

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MyHeritageが蒐集した家系関連の記録件数が50億を突破, 毎日500万増加中

家系マニアたちに人気の家族史ネットワークMyHeritageは、イスラエルのテルアビブとユタ州のLehiにオフィスがある。同社は今日、同社の家系ライブラリが収容する家系関連記録の数が50億件を超えた、と発表した。もっと正確に言うと、51億8000万件だ。

家系関連のスタートアップにとっては、もちろん、そこに集まっている歴史的記録がサービスの生命線だ。家族の係累を知りたくてサイトを訪れ、何もみつからなかったら、そこは、誰一人訪れる者のない寂しいソーシャルネットワークと同じだ。

MyHeritageと競合するAncestryは、記録の件数130億を自称しているが、MyHeritageには、毎日500万件の新しい記録が加わっているそうだ。毎日新たに加わっている家系プロファイルは、およそ100万だ。しかも、同社は2年で50億に達したが、Ancestryの130億は20年近くかかっている。

昨年MyHeritageは、 Mormon Church(モルモン教会)がスポンサーしているFamilySearchとの提携を発表した。その複数年のパートナーシップにより、新たに20億件の記録へのアクセスが可能になり、同社の擁する記録件数が飛躍的に増えたのだ。さらに最近同社は、世界中の墓石上の記録をクラウドソーシング方式でデジタル形式で保存/保全している団体BillionGraves(十億の墓)とも提携した。これからはMyHeritageからでもBillionGravesのデータベースにアクセスできる。メインのサービスは家系図の閲覧だが、ユーザ自身が新たにこのサイトに加えた家系プロファイルがすでに15億を上回り、それらに付随する古い写真は2億点を超えている。

それにしても、ここで言う‘記録の件数’とは一体何の数だろう? 同社が率直に明かしてくれたところによると、名前一つが記録一件である(婚姻に関する文書なら夫と妻で計2件となる)。同一人物が複数の名前で記録されているときには、それらを‘一つ’として数える。また、写真や新聞の切り抜き、ユーザが加えた家系プロファイル上の個人の情報なども、記録の件数として数える。

MyHeritageのファウンダでCEOのGilad Japhetは次のように語る: “うちが提供しているのは歴史的ビッグデータだ。人間が作り出す情報の量は、毎分々々膨大な量で増えつづけている。情報の過剰の中で、過去に関する精査された情報だけをうちは提供していく。高品質で希少な情報を大量に提供して、家族史の研究などのお役に立っていくことが、うちの特技だ”。

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(翻訳:iwatani(a.k.a. hiwa))